Cistanche Deserticola의 글리코 사이드의 에스트로겐 유사 효과에 대한 네트워크 약리학 연구
Apr 22, 2025
추상적인
이 연구는 에스트로겐 유사 효과의 잠재적 메커니즘을 탐구합니다.글리코 사이드Cistanche Deserticola(GCS)네트워크 약리학을 기반으로 전 사체 데이터와 결합됩니다. 총40 개의 활성 성분에스트로겐 효과를 갖는 GC 중TCMSP, Symmap, etcm, 땀, 그리고QSAR.
에스트로겐 결핍 질환에 대한 표적 정보는genecards그리고오임데이터베이스. 주요 목표가 스크리닝되었고 aPPI 네트워크건설되었습니다.기능적 농축 분석그리고KEGG 경로 농축 분석주요 목표 및 경로를 식별하기 위해 수행되었습니다.
예비 전 사체 데이터와 결합하여, 네트워크 약리학 적 예측 표적과 KEGG 경로 사이의 상관 분석을 수행하여 GC의 에스트로겐 유사 효과의 메커니즘을 추가로 밝혔습니다.
183 대상상영 및1,712 대상에스트로겐 결핍 질환에 대해 선택되었습니다.
24 핵심 주요 목표얻었습니다.
GO 기능 및 KEGG 경로 강화는 GC가 주로 다음과 같은 생물학적 과정에 작용 함을 보여 주었다.
사이토 카인 수용체 결합
에스트로겐 수용체 결합
성장 인자 수용체 결합
핵 수용체 활성
핵 호르몬 수용체 결합
스테로이드 호르몬 수용체 활성
호르몬 수용체 결합
규제 경로에는 다음이 포함됩니다.
종양 괴사 인자 (TNF) 신호 전달 경로
interleukin -17 (il -17) 신호 경로
저산소증-유도 성인 -1 (hif -1) 신호 경로
에스트로겐 신호 전달 경로
유전자 발현 변화는 전혀 검출되었다24 개의 핵심 목표제외하고MCL1그리고GCG. 차별적으로 발현 된 유전자가 포함됩니다AR, casp8, ESR1, fos, 그리고hmox1. 총68 Kegg Pathways와 함께 확인되었습니다에스트로겐 신호 전달 경로, 캠프 신호 경로, 그리고TNF 신호 전달 경로주요 경로입니다.
결론
글리코 사이드Cistanche Deserticola"다중 성분, 다중 표적, 다중 경로 길"메커니즘을 통해 에스트로겐 같은 효과를 발휘할 수 있습니다. 이 메커니즘은 다음의 규제와 관련 될 수 있습니다.
에스트로겐 신호 전달 경로
캠프 신호 경로
TNF 신호 전달 경로
천연 시티 치 추출물 알약 대신에스트로 마이 틱
키워드
글리코 사이드Cistanche Deserticola
에스트로 마이 틱
네트워크 약리학
전 사체학
공동 분석
에스트로겐여성 생식 시스템과 2 차 성적 특성의 발달에 필수적인 호르몬이며, 여성의 생식력과 성 특성을 조절하는 데 중요한 역할을합니다 [1]. 폐경기에 들어간 후 여성은 난소 기능이 감소하여 에스트로겐 생성이 감소하여 골다공증, 죽상 동맥 경화증, 폐경 증후군 및 관상 동맥 심장 질환과 같은 일련의 상태를 유발합니다 [2]. 전통적인 에스트로겐 대체 요법은 에스트로겐 결핍으로 인한 증상을 완화 시키거나 감소시킬 수 있지만,이 치료법은 또한 잠재적 부작용으로 이어질 수 있습니다 [3]. 연구에 따르면 에스트로겐의 장기 사용은 다른 부작용 중에서도 자궁 내막, 자궁 근종 및 유선 과형성의 과도한 증식을 초래할 수 있습니다. 따라서, 에스트로겐 수치가 낮은 효과를 향상시키기위한 효과적이고 안전하며 실제적인 치료법을 추구하는 것은 큰 의미와 가치가 있습니다 [4].
식물 에스트로겐은 에스트로겐 유사 활성을 발휘할 수있는 물질입니다. 그들의 분자 구조는 포유 동물 에스트로겐의 분자 구조와 유사하여 에스트로겐 수용체에 특이 적으로 결합하여 가벼운 에스트로겐 유사 효과를 생성 할 수있게한다 [5]. 연구에 따르면 식물 에스트로겐은 항-개척형 및 대사 장애 변경을 포함하여 다양한 약리학 적 영향을 미칩니다 [6].
Cistanche DeserticolaOrobanchaceae 식물의 비늘이있는 잎이있는 말린, 다육질 줄기입니까?Cistanche Deserticola yc ma. 신장 양조, 강화 본질과 혈액, 내장을 촉도하여 변비를 완화하는 것과 같은 기능이 있습니다. 그것은 일반적으로 신장 부족, 본질 및 혈액 결핍, 발기 부전, 불임, 허리 및 무릎의 약점, 장 건조로 인한 변비를 치료하는 데 사용됩니다 [7]. 연구 그룹의 이전 연구는Cistanche Deserticola에키나코 시드의 60% 이상의 함량이있는 (GCS)는 에스트로겐 유사 효과를 담당하는 주요 활성 성분입니다. GCS는 미성숙 쥐에서 자궁 계수와 자궁 내막 상피 세포의 높이를 상당히 증가시킵니다. 전 사체 분석 결과는 GC가 2,953 개의 차별적으로 발현 된 유전자를 통해 에스트로겐 유사 효과를 발휘하는 것으로 나타 났으며, 그 중 1,475 개는 상향 조절되었고 1,478은 하향 조절되었다. 이들 유전자는 주로 에스트로겐 반응, 질소 화합물 대사 과정의 양성 조절, 발달 과정 및 생물학적 과정 조절과 관련이있다. 그들은 주로에 참여합니다에스트로겐 신호 전달 경로, 캠프 신호 경로, RAP1 신호 전달 경로, 그리고MAPK 신호 전달 경로 [8-9].
전통 중국 의학 (TCM) 네트워크 약리학은 TCM 성분을 선별하고 활성 성분의 표적 단백질을 예측하고 이들 표적 단백질에 관여하는 신호 경로를 분석함으로써 질병 치료에서 TCM의 메커니즘을 탐구 할 수있다 [10-12]. GCS의 에스트로겐 유사 효과의 메커니즘을 추가로 밝히기 위해,이 연구는 그룹의 이전 전 사체 데이터를 기반으로 생물 정보학 분석을 사용하여 총계가 가능한 가능한 메커니즘을 밝혀냅니다.글리코 사이드Cistanche Deserticola 에스트로겐 같은 효과를 발휘합니다.
1. 실험 데이터베이스 및 소프트웨어
TCMSP: http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php
Symmap: https://www.symmap.org
etcm: http://www.nrc.ac.cn:9090/etcm/
땀: http://stitch.embl.de/
QSAR: http://targetnet.scbdd.com/
Pubchem: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov
단일 로트: http://www.uniprot.org/
genecards: http://www.genecards.org/
오임: https://www.omim.org/
끈: https://string-db.org/
Kegg: https://www.kegg.jp/
가다: http://geneontology.org/
r 언어: rx 64 3. 5.3 다음 패키지가있는 5.3 :
베디 디아그램
Count.r
ClusterProfiler
org.hs.eg.db
Safform2id
Perl 스크립트: addSymbol.pl
사이토 스케이프: 버전 3.7.1
2. 실험 방법
2.1 GCS의 에스트로겐 유사 메커니즘의 네트워크 약리학 예측
2.1.1 GCS의 주요 활성 구성 요소의 목표 예측
UPLC/Q-TOF-MS 분석을 사용하여 에스트로겐 유사 약리학 적 활성을 갖는 40 개의 화합물이 확인되었다 [13]. 이 화합물을 검색했습니다TCMSP, Symmap, 그리고etcm각 화합물에 대한 잠재적 유전자 표적을 찾는 데이터베이스. 또한, 복합 스마일 구조를 수입 하였다땀그리고QSAR대상을 수집하는 데이터베이스. 모든 수집 된 표적을 병합하고, 복제물을 제거하여 잠재적 인 표적 단백질을 얻었다.
2.1.2 에스트로겐 유사 목표 데이터베이스 정보
키워드 "에스트로겐 결핍"은genecards그리고오임데이터베이스.
2.1.3 "활성 화합물 - 코어 표적 - 에스트로겐 유사"네트워크의 구성
사용베디 디아그램패키지 r의 패키지, 두 소스의 대상 교차점은 벤 다이어그램으로 표시되었습니다. 후보 단백질 상호 작용 데이터를 수입했습니다사이토 스케이프 v3.9.1및 핵심 표적이 확인되었다. 코어 표적의 상응하는 화합물을 선택하고 "화합물 - 코어 타겟 - 에스트로겐 유사"네트워크를 시각적으로 분석하고 구성했습니다.사이토 스케이프 v3.9.1.
2.1.4 PPI 네트워크의 구성
핵심 목표 정보가끈 database, selecting the species "Homo sapiens" and setting the confidence score to >0. 7 단백질-단백질 상호 작용 (PPI) 네트워크를 구성합니다. 그만큼Count.rR의 패키지를 사용하여 시각화 된 코어 표적 단백질 중에서 가장 높은 연결성을 갖는 상위 20 개의 코어 유전자를 분석하고 선택 하였다.
2.1.5 GO 기능 강화 분석 및 KEGG PATHWAY 농축 분석
핵심 대상 유전자의 경우 Go 및 Kegg 데이터베이스 검색을 R 패키지를 사용하여 수행했습니다.org.hs.eg.db, Safform2id, 그리고ClusterProfiler. 보정 된 p- 값을 갖는 상위 20 개의 경로는 막대 차트로 시각화되어 GCS의 에스트로겐 유사 효과의 핵심 표적에 의해 풍부한 유의 한 기능적 주석 및 경로를 분석했습니다.
2.2 전 사체 데이터와 통합
2.2.1 예측 된 표적과 전 사체 유전자 간의 상관 관계 분석
네트워크 약리학 예측의 종은 인간이기 때문에 표적은HGNC"Tools-Hcop"기능을 통해. 차등 유전자의 발현 수준은 전 사체 시퀀싱에서 GCS 그룹과 대조군 사이에 분석되었다 [9].
2.2.2 네트워크 약리학 예측과 전 사체 KEGG 경로 간의 상관 관계 분석
네트워크 약리학 (쥐 상 동체 유전자로 변환)에 의해 예측 된 핵심 표적 유전자는 R 패키지를 사용하여 KEGG 데이터베이스에서 검색되었다.생체 전도체그리고ClusterProfiler함께id2symbol.pl스크립트. 이 종은 "rno"로 제한되었고 padjust <0가있는 경로를 스크리닝 하였다. 네트워크 약리학 예측을 통해 풍부한 KEGG 경로와 GCS의 에스트로겐 유사 효과와 관련된 전 사체 실험 사이의 중첩 경로를 식별하기 위해 벤 분석을 수행 하였다.
