기존 약물로 신장암 치료에 대한 새로운 희망

투명 세포 신세포 암종(ccRCC)은 신세포 암종(RCC)의 가장 흔한 하위 유형으로, RCC 사례의 약 75%를 차지하고 RCC 사망의 대부분을 차지합니다. 수많은 연구에서 VHL의 이중 가닥 불활성화, 염색질 리모델링 및 히스톤 수정 관련 유전자 PBRM1, BAP1 및 SETD2의 돌연변이와 같은 중요한 동인 이벤트를 밝히는 ccRCC의 게놈 지도를 설명했습니다. 대조적으로 전사 수준의 ITH는 ccRCC에서 잘 이해되지 않으며 부분적으로는 종양 미세 환경(TME)을 구성하는 다세포 생태계의 복잡성 때문입니다. 특히, ccRCC의 TME에서 악성 및 비악성 세포의 표현형 이질성과 그것이 지리적 위치와 어떻게 관련되어 있는지는 잘 알려져 있지 않습니다.

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ccRCC는 면역 세포에 의해 심하게 침윤되는 암 유형입니다. 면역 체크포인트 차단(ICB) 요법을 통해 적응 면역을 활용하면 ccRCC에서 면역 미세 환경의 중요성을 강조하면서 환자 생존을 효과적으로 향상시킬 수 있습니다. 다수의 시퀀싱 기술을 사용하는 이 면역 환경의 특성화는 면역 세포의 별개 집단을 해부하는 능력에 의해 제한되었습니다. 질량 분석법을 사용하는 ccRCC의 포괄적인 단일 세포 면역 아틀라스는 ccRCC 종양 생태계에서 면역 세포의 다양성을 보여줍니다.

단일 세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)의 최근 발전과 암 연구에 대한 적용은 종양 세포 표현형 이질성, 종양의 면역 환경, TME의 복잡성과 가소성, TME의 세포성에 대한 이해에 혁명을 일으켰습니다. 통신 사이. 특히, ccRCC에서 최근의 scRNA-seq 연구는 근위 세뇨관 세포에서의 기원을 뒷받침하는 증거를 제공했습니다.

비만은 신장암 진단의 가장 강력한 위험 요소 중 하나이지만 개선된 종양학적 결과와도 관련이 있기 때문에 신장 주변 지방에 관심이 있습니다. 종양, 면역 및 간질 세포와 관련된 RCC의 공간적 이질성 및 진화와 더 넓은 TME에서의 상호 작용에 대한 이해는 여전히 부족합니다. 이 문제를 해결하기 위해 다중 영역 기반 scRNA-seq를 12명의 환자에 대해 수행하여 말초 혈액, 정상 신장, 종양 코어의 4개의 뚜렷한 공간 영역 및 종양-정상 인터페이스를 샘플링하고 레이저 포획 미세해부(LCM) 종양을 샘플링했습니다. 샘플은 부분적인 철저한 엑솜 시퀀싱을 받았습니다.

더 세분화된 지역 transcriptome 차이는 공간 transcriptomics를 사용하여 종양-정상 인터페이스와 종양 코어에서 세포 프로파일을 비교하여 추가로 검증되었습니다.

연구자들은 12명의 신장 종양 환자로부터 270개 이상의000 단일 세포와 100개의 미세 절개를 연구했습니다. 종양의 다른 부분과 정상 신장 조직에서 샘플을 채취했습니다. 이러한 샘플은 조직 내 특정 세포의 정확한 위치를 매핑하기 위해 단일 세포 RNA 시퀀싱 및 공간 전사체학을 사용하여 분석되었습니다. 이 분석은 IL1B 유전자를 발현하는 대식세포인 특정 유형의 면역 세포가 종양 가장자리에 풍부하다는 것을 강조했습니다.

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