SARS-CoV-2 변종이 가정 연구에서 얼마나 빨리 전송되는지 이해
Mar 29, 2022
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생성 시간 분포 인 g (t)는 역학자가 질병 확산을 모니터링하고 간단한 정체성을 사용하여 매일보고 된 새로운 사례 χ (t)를 기반으로 중재 효과를 평가하는 데 사용됩니다.
Rt = χ(t)/∫0∞χ(t–s)g(s)ds
여기서 Rt는 특정 시간(t)에서의 유효 생식 수이다. 추가적으로, 생성 시간 분포는 격리 및 격리 정책을 안내하기 위해 보건 당국에 의해 사용된다(예를 들어, 식별된 케이스의 밀접한 접촉은 최대 생성 간격과 최대 잠복기에 대응하는 기간 동안 자가 격리에 권장될 수 있다).
지배적 인 파도의 연속적인 파도SARS-CoV-2변종은 전송 가능성이 증가하는 일반적인 추세를 보여 주었다. 우려되는 신흥 변종의 상대적 투과율은 이전 변종보다 높았으며, 알파 변이체 (B.1.1.7)의 경우 Rt가 29-90 %, 델타 변종의 경우 97 %가 증가한 것으로 알려졌다.(B.1.617.2).1,2 변형의 전송 및 제어에 대한 대부분의 모델링 연구는 입력으로 생성 시간 분포를 필요로합니다. 데이터가 불충분하기 때문에, 새로운 균주의 분석은 종종 조상 균주와 동일한 생성 시간 분포를 가정한다.1-3 몇몇 연구4,5는 조상 균주와 비교하여 알파 및 델타 변이체에 대해 3·5-4·4일의 평균 잠복기가 단축되었다고 보고했으며, 이는 증세 전 전염성을 고려할 때 생성 시간이 짧다는 것을 암시한다.SARS-CoV-2.접촉 추적 데이터로부터 이러한 변종에 대한 생성 시간을 직접 추정한 연구는 소수에 불과합니다.4 일부 연구에서는 우려되는 변종에 대한 직렬 간격을 추정했지만,6 이 간격은 생성 시간을 확실하게 근사치로 계산할 수 없습니다.SARS-CoV-2왜냐하면그것의 무증상 전염성의.
영국의 227 가구를 기반으로, 윌리엄 하트와 동료7는 알파 및 델타 변종에 대한 생성 시간 분포에 대한 오랜 필요 추정치를 제공합니다. 이러한 추정치의 신뢰성은 (1) 적절한 표본 크기를 가진 엄격하게 설계된 예비 가정 연구, (2) 질병의 자연사와 가정 내 전염의 불확실성을 설명하는 모델링 프레임 워크, (3) 연령 그룹 및 지수 사례 및 가족 접촉의 예방 접종 상태에 따라 계층화 된 세련된 분석, (4) 변화하는 가정에 대한 매개 변수의 추정 가능성과 결과의 견고성에 대한 포괄적 인 평가. 저자는 모델러가 필요로하는 고유 생성 시간과 가구 생성 시간에 대한 추정치를 제공하며, 이는 대부분의 기존 추정치와 유사합니다.SARS-CoV-2접촉 추적 데이터로부터 경험적으로 전송 쌍을 식별하는 전통적인 방법에 의해 얻어진다. 현재 모델은 아마도 민감한 접촉에 대한 사례 간의 경쟁을 명시 적으로 설명하기 때문에 전송 쌍을보다 정확하게 식별 할 수 있습니다.
저자들은 평균 고유 생성 시간을 4·7일(95% 신뢰할 수 있는 간격[CI] 4·1-5·6)으로 추정하고 델타 변종에 대한 가구 생성 시간은 3·2일(2·5-4·2)로 추정한다. 이 추정치는 평균 고유 생성 시간의 경우 5·5일(4·7-6·5), 가구 생성 시간의 경우 4·5일(3·7-5·4)이었던 알파 변종에 대한 추정치보다 짧습니다. 델타 변종의 평균 가구 생성 시간은 조상 균주(4·0-5·2)8보다 분명히 짧으며, 중국의 비가정 연구에서 델타 변종에 대한 2·9일(2·4-3·3)의 또 다른 추정치와 유사하다.4 저자들은 델타 변종에 대해 평균 가구 연속 간격이 1·8일(95% CI 1·0-2·4)이라고 추정했다. 이는 아시아 국가4,6,7에서 2·0-2·5일의 추정치와 일치하며, 알파 변이체에 대해 추정된 3·5일(2·7-4·1)보다 실질적으로 짧다. 알파 변이체와 비교하여 델타 변이체에 대한 가정용 세대 시간(28%, 95% CI 0-48%)보다 가구 연속 간격(48·6%)이 비례적으로 더 크게 감소한 것은 델타 변이체가 증상 전 감염 기간이 약간 더 길고(7·8%), 이 기간 동안 상대적 투과율(39·3% 더 높음)의 결과일 가능성이 가장 높다(하트와 동료들의 기사 부록 2 p 24에 있는 정보를 기초로 계산됨). 7
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백신은 심각한 질병과 사망을 예방하는 데 지속 가능한 효능과 효과를 보여주었습니다.SARS-CoV-2임상 시험 및 관찰 연구에서, 우려되는 새로운 변종에 대한 효능의 중간 감소만이 있었다.9 비록 연구에서 완전히 백신을 접종한 감염자 또는 감염자에 비해 약간 더 긴 가정 생성 시간이 나타났지만, 획기적인 전염의 상당한 지연에 대한 명확한 증거는 없다. 그러나, 백신 접종 상태에 의한 계층화 후 작은 표본 크기가 적당한 지연을 검출하는 연구의 힘을 감소시킬 수 있다. Hart와 동료들의 연구에서 볼 수 있듯이 알파 및 델타 변종의 생성 시간을 줄이는 데 백신의 부적절한 효과7는 노출 된 밀접한 접촉자에 대한 격리 관행이 예방 접종 상태에 관계없이 변경되지 않아야한다는 것을 암시합니다.
급증하는 오미크론 변이체 (B.1.1.529)는 미국 질병 통제 예방 센터 (CDC)에 따르면 추가적인 성장률 이점 (2·0-3·5 배)을 얻었으며, 이는 향상된 고유 한 전염성과 면역 탈출의 조합으로 설명 될 수 있습니다. 오미크론 변이체의 관찰된 더 짧은 잠복기(약 3일)는 더 짧은 생성 간격을 의미한다.10 하트와 동료들의 연구와 유사한 설계를 가진 가정 연구는 오미크론의 전염성 및 생성 간격 및 백신 효과를 평가하기 위해 수행되어야 하며, 필요한 경우 통제 정책이 적시에 수정될 수 있도록 해야 한다.
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*양양, 에벤 케나
생물 통계학과, 공중 보건 보건 전문직 대학 및 신흥 병원균 연구소, 플로리다 대학, 게인즈빌, FL 30611, 미국 (YY); 생물 통계학과, 공중 보건 대학, 오하이오 주립 대학, 콜럼버스, 오, 미국 (EK)
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참조
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2 Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, et al. 2021 년 6 월 현재 우려되는 SARS-CoV-2 변종의 전송 가능성 및 글로벌 확산이 증가했습니다. 유로 서베일 2021; 26: 2100509.
3 Elliott P, Haw D, Wang H, et al. 기하 급수적 인 성장, SARS-CoV-2의 높은 유병률 및 델타 변종과 관련된 백신 효과. 과학 2021; 374: eabl9551.
4 Zhang M, Xiao J, Deng A, et al. COVID-19 델타 변종 B.1.617.2 - 광동성, 중국, 2021 년 5 월 ~ 6 월의 발병의 전염 역학. 중국 CDC Wkly 2021; 3: 584–86.
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6 류에스, 김D, 임J-S, 알리 ST, 카울링 BJ. SARS-CoV-2 델타 변형 우세, 한국 동안의 직렬 간격 및 전송 역학. Emerg Infect Dis 2021; 12 월 14 일 온라인 게시.
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8 그리핀 J, 케이시 M, 콜린스 Á, 외. COVID-19의 연속 간격 및 생성 시간에 대한 사용 가능한 증거의 신속한 검토. BMJ 오픈 2020; 10: e040263.
9 Chemaitelly H, Tang P, Hasan MR, et al. 카타르에서 SARS-CoV-2 감염에 대한 BNT162b2 백신 보호 면제. N Engl J Med 2021; 385 : e83.
10 Jansen L, Tegomoh B, Lange K, et al. SARS-CoV-2 B.1.1.529 (omicron) 변종 클러스터 조사 - 네브래스카, 11 월 - 2021 년 12 월. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2021; 70: 1782–84.
