다인자 혈청 프로파일링은 SARS-CoV-2 면역에 대한 기존 인간 코로나바이러스 반응의 기여도를 분석합니다(2부)

자세한 내용을 알아보려면 plz에 문의하십시오.david.wan@wecistanche.com

해결 의 일시적인 항독소 역학 ~에 의해 ABCORA 세르-오프로fi링.  십자가-조립식 가구분석 의 SARS-CoV 이후의 항체 반응성-2RT-P에 의한 진단CR (N = 369) 그리고발병 후 의증상 (N = 333) 밑줄 친 그만큼 용량 의 ABCORA 세르- 오프로fiSARS-CoV의 발병, 정점 및 약화를 분석하기 위한 링-2 항독소 응답 (무화과. 5a, b, 보충 그림 11). 개인에서 ~와 함께 a 모두 다 아는 데이트 의 fi첫째 SARS-CoV-2 RT-PCR 진단 또는 증상의 시작, ABCORA 2.3 감지에드 일찍 혈청전환-시온 안에 98%(48의 49) 그리고100%(9의 9) 의 개인 이내에7 날 RT-PCR 후 및 증상의 발병. 게다가 IgM 그리고 IgA 반응성, IgG 반응은 ABCORA 2.0 감염 며칠 후(보충나타리무화과. 11a).

코호트의 종단적 평가의 회복기 환자 위로에게  11  감염 후 몇 개월(120에서 251 측정 환자)  강조 표시된그만큼일시적인역학의 SARS-CoV-2 결합 항체. 우리는 붕괴 o를 추정했다f 제본 반동 고용 a멱법칙 혼합 모델과 중요한 식별 레두행동 안에 RBD, S1, 그리고 N 안에 모두 이그 하위 유형 (무화과. 5b) ~와 함께반감기 범위 ~에서 67 에게 404일, IgG N 역가가 감소하면서 가장 빠른,안에선~와 함께이전   보고서10.   반-생명의그만큼 중립적i자시션 관련 있는 IgG 응답 에게 RBD 그리고 S1 ~이었다 125 및 각각 404일. 흥미롭게도 중화의 동역학 항체 했다 ~ 아니다 거울 그만큼 부식 요금 결합 관찰 항체. 중화 활성 감소이 ~에 a 더 느리게비율, ~와 함께 a 반-991일의 수명(그림.5씨). 이것은 부분적으로혼합반동무늬~와 함께약간개인전시증가하다 안에 중립화 활동 게시하다 긍정적인 사스-코로나-2 RT- PCR5, 다른 사람들의 중화 활동이 급격히 감소하는 동안 (보충 그림 11c).

효과 의 HCV 면역 ~에 사스-코로나-2 인수. 에게

기존 데이터 간의 상호 의존성을 조사할 수 있습니다.ng 임마단일성 에게 HCoV 그리고 사스-코로나-2 전염병, 우리 퍼지는 그만큼ABCORA 구슬 항원 정렬 에게 포함 S1 단백질 의 모두 네 순환  HCoV  (HCV-NL63,  HCV-229E, HCV-HKU1,HCV-OC43) (수보충 무화과. 12a). 에 따라 에게 그것의용량 에게 감시 장치 항체 에게 fi이브 코로나바이러스, 우리 라고 분석 ABCORA 5.0 그리고 훈련 그리고 검증된 그것 ~에 그만큼 같은코호트 ~처럼 ABCORA 2.0 (무화과. 1). 직접 비교할 수 있도록 ABCORA 2.0 그리고그만큼사용 중화 예측 모델 중 우리는사용된 그만큼 한계점-/ABCORA 2의 SOC 기반 분석 설정.0 또한 ~을 위한 ABCORA 5.0. 기반을 둔 ~에 ABCORA 5.0 측정 훈련 코호트 I–III, 우리 고안 둘 무작위의 숲-기반 분석 모델. 앙코라 5.4 포함 혼자서 그만큼 12 사스-코로나{0}} 매개변수 및 ABCORA 5.5에는 다음이 포함됩니다.d 안에덧셈 그만큼  S1  HCoV 측정 첨가 총 24개까지의 매개변수. 에 비유하여ABCORA 2.3, 혼입 의 HCV 반동 ~ 안으로 그만큼 모델~였다 유리한. 앙코라 5.5 최고 감도 제공 그리고특정fi도시 사이 그만큼 분석 알고리즘 조사 ABCORA 5.0 (보충 그림 12b, 보충 표 10).

상호 의존성항독소  반동  에게  그만큼  네 HCoV 및 SARS-코로나-2 미러링 무엇 우리 이전에 관찰

~을 위한 홍콩1 ~와 함께 a 특히 높은 상관관계 의 IgM 반동 의

사스-코로나-2 그리고 HCoV 안에 미리-전 세계적인 유행병 개인, 특히 안에저것들~와 함께최근의  HCV  전염병  (보충그림 13). HCV 감염은 빈번하지만 계절에 따라 달라질 수 있습니다.그리고그만큼널리 퍼짐 의 개인 HCV 감염 요동치다41,42. 인라인 이것으로 ABCORA에 의해 측정된 HCV 반응의 유병률 5.0 안에 현지의 피 기증자 안에 1월 2019 (N = 285), 5월  2019   (N=288) 및 2020년 1월(N=252) 변경됨상당히  (무화과. 6). 에게 ~할 수 있게 하다 a 시각-통제된 비교 HCV 반동 ~ 사이 사스-코로나-2-감염된 그리고 건강한 기증자, 우리 상영 피 기증자 ~에서 5월 2020  (N = 672), 언제 사스-코로나-2 널리 퍼짐 ~였다 취리히에서는 2% 미만으로 추정되며, 스위스43, ~에 의해 ABCORA 2.{{0}}/5.0 및 다음을 포함하는 모든 샘플 제외 사스-코로나-2 반동. 그만큼 잔여 5월 2020코호트(N=653)형성된 a 전 세계적인 유행병, 건강한 기증자 제어 그룹. 재미있게,2019년과 2020년의 HCV 반응성 패턴 차이에드 대체로 ~처럼 평가 ~에 의해 하나-방법 분산 분석, 2020년 1월비교적 가장 낮은 그리고 5월 2020 그만큼 제일 높은 이가 그리고 IgG반응성이, 어느 5월 나타내다 a 나중에 습격 의  HCV 감염병 유행 2019년 대비 2020년(2020년 5월의 t-검정 대 기타 그룹어떻게 안에 무화과. 6).

가장 흥미로운 것은 시간 일치 분석 com껍질 벗기기 5월2020년 SARS-CoV-2-양성 환자 샘플이 있는 건강한 기증자l에드안에4월, 5월, 그리고 6월 2020 (N = 65) 노출된 시그니fi열심히 낮추다HCV 반동 안에 사스-코로나-2 긍정적인 환자 (무화과. 7a). 이것 무늬 ~였다 또한 분명한 언제 우리 포함하도록 분석을 확장했습니다. 그만큼가득한보병대의 사스-코로나-2  측정된 감염자~와 함께  ABCORA  5.0 (N=389, 2020년 3월부터 샘플링2월  2021,  보충  무화과. 14). 전반적으로 이러한 결과 안에d에이티드 저것 미리-기존의 면역성 있는 응답 에게 HCoV 5월 에게 a SARS-CoV-2 감염으로부터 어느 정도 보호i~에.

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무화과. 5 모니터링 일시적인 진화 의 항독소 응답.  ABCORA 2.3 정의 의 혈청 양성 안에 기증자 ~와 함께 긍정적인 RT-PCR 확인 사스- CoV-2 감염 및 알려진 RT-PCR 날짜(N = 369). 혈청 양성 평가~에 대한 혈장 견본 추출 시각 가리키다사후 진단 ~이다 묘사. 회색 음영 지역 하이라이트 그만큼 첫 번째 일곱 날 ~부터 긍정적인 RT-PCR 발각. b거듭제곱 법칙 모델, ~와 함께 시각 ~부터 RT-PCR ~처럼 결정된 효과 무작위 효과로서의 개인, 추정 그만큼 부식 의 ABCORA 2에 기반한 항체 결합 활성.{1}} 총 120명의 개인에서 1~4개의 세로 시점에서 측정251 측정NTS. 보라 윤곽 대응하다 에게 그만큼 모델의 견적 그리고보라색 음영 지역 에게 그만큼95%신뢰 간격. 항독소 반-생명 (t1/2 일에) ~에서 중요한 모델 ~이다 묘사. 중요성 ~였다 평가 사용 새터스웨이트 근사 ~을 위한 a 둘-양면 t-테스트 ~에 그만큼 경사 매개변수. c 거듭제곱 법칙 모델, ~와 함께 시각 ~부터 RT-PCR ~처럼 결정된 효과 그리고 개인 ~처럼 a 무작위의 효과, 추정 그만큼 부식 의 중화 용량 ~에 251측정 ~에서 120 개인. 뿐 개인 ~와 함께 NT50 > 100~에 그들의 첫 번째 측정 ~이었다 사용된 에게 추정 그만큼 반-삶. 그만큼 자주색 라인 대응 에게 그만큼 모델 견적 그리고 그만큼 자주색 음영 처리 지역 에게 그만큼95%신뢰 간격. 중요성 ~였다 평가 사용 새터스웨이트 근사 ~을 위한 a 둘-양면 t-테스트 ~에 그만큼 경사 매개변수.

무화과. 6 계절 그리고 연간 fl요동 안에 HCV 반동. 반동 에게 인간 코로나바이러스 (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-홍콩1, HCV-OC43)~였다 비교 ~에 의해 ABCORA 5.0. 반동 안에 건강한 피 기증자 ~에서 2019 그리고 2020 ~였다 비교. 사전-전 세계적인 유행병 샘플 포함: 1월 2019 (N = 285), 5월 2019 (N = 288), 1월 2020 (N = 252). 샘플 ~에서 5월 2020 (N = 672) ~이었다 모은 ~ 동안 그만큼 전 세계적인 유행병 안에 스위스. 샘플만 없이 사스-코로나-2 특정한 반동 ~처럼 한정된 ~에 의해 ABCORA ~이었다 포함 (N = 653). 별 대응하다 에게 수준 의 중요성 의 둘-양면 t-테스트 비교 그만큼 가리키는 여러 떼. 레벨 의 중요성 ~이다 수정 ~에 의해 그만큼 본페로니 방법 ~을 위한 다수의 테스트 그리고 가리키는 ~처럼 따르다:        *p< 0.05/36, **p < 0.01/36,="">p< 0.001/36.상자 그림 대표하다 그만큼 수행원: 중앙값 ~와 함께 그만큼 가운데 선, 높은 그리고 낮추다 사분위수 ~와 함께 그만큼 상자 제한, 1.5x 사분위수 범위 ~와 함께 그만큼 구레나룻, 그리고 이상치 ~와 함께 포인트들.

효과 의  HCV  면역 안에  사스-코로나-2  전염병.  에게

HCV 면역과의 상호의존성을 더 탐구하고, 우리는xt조사 ~이든 HCV 응답 ~이다 연결된 진화에의 사스-코로나-2 항체. 에게 이것 끝, 우리는 항체를 분석했습니다샘플로 채취한 204명의 혈장 내 반응안에 60 SARS-CoV 이후 일-2선형 회귀 모델을 사용한 진단 RT-PCR 및 HCV 양성 이후 연령, 성별 및 시간에 따라 조정반동. 에게 충이 되다 HCoV 반동 ~ 안으로 높은 그리고 낮은 HCoV 활동, 중앙값로그 MFI-적 ~이었다 드fi네드 ~을 위한 각 HCV 그리고항독소수업. 상응하는 것보다 높은 LogMFI-FOE최소한 중앙값t 삼 HCoV (홍콩1, OC43, NL63, 또는 229E) 특정에서c 이그 수업 ~이었다 순위 ~처럼 가지고 높은 HCV 활동이 클래스 내에서. 첫째, 동일한 안티들 간의 반응성만b오디클래스 워e 탐험 안에 그만큼 모델 (i.e., HCV IgG 높은 ~에 사스- CoV{0}} IgG). 우리는 예외를 관찰리강한상호 의존성 ~을 위한 이가 그리고 IgM 응답 SARS-CoV-2에모두~이었다시그니fi열심히더 높은안에개인~와 함께높은 HCV반동 (무화과. 7b). 이것 기존 HCV가 면역을 제공할 수 있습니다e  이점 안에 설치 사스-코로나-2 응답.HCV IgG와 SARS-의 상호의존성 코로나-2  특정 IgG는 S2 반응에 대해서만 관찰되었습니다. 흥미롭게도 이 발견을 뒷받침하는 HCV S2 h엘퍼 응답~이었다 최근에 설립하다 에게 후원 사스-코로나-2 면역, 안에특정한 S2 항체 활성31. SARS-CoV-2 IgG가짓다 ~에 최근의 HCV 이가 그리고 IgM 응답 우리 다음 조사HCV IgM과 IgA가 유전자에 연결되어 있는지 여부평가 사스-코로나-2 특정fic  IgG수준.IgM에 대한 효과는 분명하지 않았지만 우리는 징후를 관찰했다ifi캔트 협회 의 높은 HCV 이가 활동 ~에모두네정확히 잰  사스-코로나-2  응답  (무화과.  7c,  d). 이것 강력하게 제안저것최근의  HCV  전염병 가지다a 베네fi시알 SARS-CoV-2 항체 반응 탑재에 대한 영향세.

~ 안에 그만큼 다음 분석, 우리 조사 만약에 미리-기존의 HCV 면역가지다  코로나바이러스의 질병 중증도에 미치는 영향{0}}. 이를 위해 우리는조사 HCoV 면역 안에 80 입원 및 입원하지 않음개인 감염된 ~을 위한 30일 미만(그림.8ㅏ). 제어 나이와 성별, 우리는 안녕을 가진 개인이흐 미리-기존의 HCV 반응성은개미낮추다  DDS에게필요하다입원  (물류회귀  또는 = 0.16, 95% CI(0.04, 0.67), 그림.8b, 보충 그림 15). 추가 전략ifi양이온 의p환자 ~에 의해 ~이든 그들 필수의 치료 ~에  중환자실 보여 주었다 a 환자가TS ~와 함께 높은 HCoV 응답 필요한 요금 입원 ~와 함께 강한 케어 (서수 회귀또는 {{0}}.36, 95% CI(0. 13, 0.96), 그림.8나, 보충F이그. 15). 따라서, 개인 ~와 함께 높은 HCoV 수준 가졌다 a 64% 낮아진 확률 에 따라 입원이 필요하거나식당 계급 회귀 분석 비교 입원 안에 정기적인 병동, 안에 중환자실, 그리고입원하지 않는다d 개인   (무화과.  8a,  b).   집합적으로,  이것들 관찰 결과 교차 보호 효과가 강력하게 시사됨of HCV사스에 대한 면역 방어 형성에 대한 면역-코로나-2.

무화과. 7 효과 의 미리-기존의 HCV 면역 ~ 동안 사스-코로나-2 인수. a 시간-일치 비교 의 ABCORA 5.0 반동 ~을 위한 사스-코로나-2그리고 HCoV 안에 건강한 그리고 사스-코로나-2 감염된 개인. 건강한 기증자 ~이었다 샘플링 안에 5월 2020 (N = 653; 푸른). 혈장 ~에서 사스-코로나-2     감염된 개인s ~였다 모은 ~ 사이 4월–6월 2020 (N = 65; 빨간색). 보다 보충 무화과. 14 ~을 위한분석 의 그만큼 가득한 사스-코로나-2 긍정적인 보병대(N = 389). 회색 상자 나타내다 가치 ~ 위에 그만큼 개인 MFI-적 자르다-오프 ~을 위한 사스-코로나-2 특정한 응답 ~을 위한 각 항원. 별 대응하다 수준으로 의 중요성 의 둘-양면 t-테스트 비교 부정적인 ~ 대 긍정적인 환자. 레벨 의 중요성 ~이다 수정 ~에 의해 그만큼 본페로니 방법 여러 테스트 그리고 가리키는 ~처럼 따르다: *p< 0.05/12, **p< 0.01/12, ***p< 0.001/12(IgG 홍콩1: p = 0.66, IgG OC43: p = 0.45, IgG NL63: p=3.3 × 10−04, IgG 229E: p = 1.6 × 10−05, IgA HKU1: p=1.8 × 10−03, IgA OC43: p=1.3 × 10−05, IgA NL63: p=1.4 × 10−07, IgA 229E: p=3.0 × 10−05, IgM HKU1: p = 3.3 × 10−08, IgM OC43: p = 4.3 × 10−03, IgM NL63: p = 1.1 × 10−07, IgM 229E: p = 2.7 × 10−02). 상자 그림 대표하다 그만큼 수행원: 중앙값 ~와 함께 중간 선, 높은 그리고 낮추다 사분위수 ~와 함께 그만큼 상자 제한, 1.5x 사분위수 범위 ~와 함께 그만큼 구레나룻, 그리고 이상치 ~와 함께 포인트들. b 선의 회귀 보여주는 모델 그만큼 협회 ~ 사이 사스-코로나-2 그리고 HCV 신호 안에 204 사스-코로나-2 긍정적인 환자 ~와 함께 모두 다 아는 날짜 의 먼저 긍정적인 RT-PCR 검출. 영향 이내에 그만큼 같은 항독소 수업 ~이다 조사. 그만큼 모델 ~이었다 조정 ~에 나이 (운형자 ~와 함께 3 학위 의 자유), 성별, 이후 시간 긍정적인 RT-PCR (운형자 ~와 함께 3 학위 의 자유), 그리고 수준 의 HCoV 반동. 샘플 ~이다 설계된 에게 항구 높은 HCV 반동 만약에 그들 쇼 ABCORA 5.0 HCV로그 MFI-적 가치 더 높은 ~보다 그만큼 동 중앙값 안에 ~에 최소 3 HCoV 측정 (홍콩1, OC43, NL63, 또는 229E). 곡선 대응 에게 그만큼 모델의 견적 그리고 음영 처리 지역 에게 그만큼95%신뢰 간격. p-가치 ~이었다 얻은 ~에 의해 달리기 a 둘-양면 학생 t-테스트 에 매개변수 관련된 ~와 함께 HCV 반동 안에 그만큼 선의 회귀. c 선의 회귀 모델 전시 그만큼 협회 ~ 사이 사스-코로나-2 IgG 및 HCV 이가 신호. 곡선 대응하다 에게 그만큼 모델의 견적 그리고 음영 처리 지역 에게 그만큼95%신뢰 간격. p-가치 ~이었다 얻은 ~에 의해 달리기 두-양면 학생 t-테스트 ~에 그만큼 매개변수 관련된 ~와 함께 HCV 반동 안에 그만큼 선의 회귀. d 선의 회귀 모델 전시 그만큼 협회SARS-CoV-2 IgG와 HCV IgM 신호 사이. 곡선은 모델의 추정치에 해당하고 음영 영역은 95% 신뢰 구간에 해당합니다. p-값~이었다 얻은 ~에 의해 달리기 a 둘-양면 학생 t-테스트 ~에 그만큼 매개변수 관련된 ~와 함께 HCV 반동 안에 그만큼 선의 회귀.

논의하다이온

드fi니션 의  사스-코로나-2  면역 예방 접종 후 그리고감염이 시급하다44–46. 해독 안티신체상관 관계의 사스-코로나-2  보호그리고모니터링 백신 대응은 앞으로의 도전 과제입니다. 크기그리고 장수 의 보호 항독소 응답 에게 자연스러운 감염과 다른 백신 필요 에게 ~이다 검사 에게 이해하다매개변수 저것 모양 보호 응답 및 지침 결정 무반응자의 재접종 및 예방접종에 대하여n성소설 일어나는 사스-CoV{0}} 변종47. 마찬가지로 생성 수단은 de novo 감염을 혈청학적으로 구별합니다.전염병,그리고 백신 응답, 그들의 내구성 그리고 실패 ~ 할 것이다 남아있다critical ~을 위한 객관적인 진단.

여기 우리 입증하다 그만큼 높은 공익사업 의 다중-매개변수 세르- d의 주요 문제를 다루기 위한 프로파일링efi닝  사스-코로나-2 면역.  동시발각의 에 대한 항체 반응 범위의 사스-코로나-2  항원그리고다른  이그클래스~와 함께 ABCORA  세로프로fi링의 포괄적인 그림을 제공했습니다. 단일 검사에서 SARS-CoV-2 혈청학적 상태,n e 존재를 결정하기 위한 임상 진단에 유용of 재감염,  드fi네재감염,  그리고대답하다에게백신 접종. 전산모델링또한허용된예측 플라즈마 중성실현 용량 ~에서 ABCORA 결과, 활성화 a포괄적인 평가 의 사스-코로나-2 항독소 역학 그리고 그들의 와 상호 작용하다HCV 응답. 우리 공부했다 둘 ABCORA 시험버전 일~에 둘 다 정확히 잰 HCV 반동 나란히 그만큼  12 사스-코로나-2 매개변수.ANCORA 2에는 다음의 S1 항원이 포함되었습니다.홍콩1. 앙코라 5 포함 S1 의 모두 네 순환 HCV.특히, 계산적인 모델 저것 포함 그만큼 HCV측정 허용된 a 더 높은 정도 안에 결정 사스-코로나- 2 혈청 양성, 높음조명 상호 의존성 ~ 사이 HCoV그리고 사스-해결해야 하는 CoV{0}} 응답입니다.

녹음 반동 에 맞서 모두 네 HCoV 안에 사스-코로나-2감염되지 않은 그리고감염된개인우리관찰흥미로운협회. 유감염개인표시더 높은  HCV감염된 개인에 비해 반응성a기부금 의 HCV 면역 에게 일찍 방어 에 맞서 사스-코로나- 2. HCV 면역은 SARS-CoV에도 긍정적인 영향을 미칠 수 있습니다.-2전염병. ~ 안에 합의 ~와 함께 다른 보고서, 우리 유명한 a교차 수유 의 사스-코로나-SARS-CoV-2 감염에서 2 및 HCV 반응31,48 ~와 함께 개인 ~와 함께 높은 HCV 반동 발전하다-오핑 더 높은 사스-코로나-2 항독소 수준. 대부분 특히, 기존 HCV 면역 가졌다  타격 ~에 질병 심각성 우리의 보병대. 사스-코로나-2 감염된 개인 ~와 함께 낮은 HCV 반응성 가졌다 a 더 높은 있을 수 있는 일 의 요구하는 입원.

하는 동안우리의공부하다단독으로 측정된 항체 반응,잠재적인보호효과의 HCoV사스에 대한 면역-코로나-2 인수 ~해야 한다 ~ 아니다 ~이다 본~처럼제한된 에게 항체 활성. 항체 세포 면역은 둘 다 관련이 있을 수 있습니다.그리고 콘서트 활동31,49–51. 또는 항체 반응s에스m안심 안에 그만큼 현재 공부하다 5월 혼자서 문서 최근의 HCV 감염n 그리고 배달 a 대리 측정 의 다른 보호HCV 응답. 그만큼 링크 ~ 사이 더 높은 HCV  그리고 사스-코로나-2 반동 감염된 개인에서 특히 흥미롭습니다. 가장 강한 효과 ~이었다 본 ~을 위한 IgM 그리고 이가 HCoV 응답, 수g몸짓 저것 최근의 HCV 면역 제공  일찍 후원 에게 SARS-CoV-2 항체 개발엔트.  이든이것~이다~로 인한에게 교차 반응성 B 세포 반응그만큼  사스-코로나-2면역 빌드 ~에 그리고 성숙하다 또는 ~이든 십자가-반응성 T 돕는 사람활동플레이제안된 지배적인 역할31  될거야 중요한 에게 해결하다 안에 앞으로-오는 연구. 그만큼 정확한 역할과 티민g 의 HCoV응답영향을 미치는  사스-코로나-2  항독소응답 또한 남아있다 에게 ~이다 드fi네드. 일찍 낮은-에프fi니티 HCoV 반응 5월 가지다 a 긍정적인 타격 ~에 그만큼 개발 사스-코로나-2 면역기억을 형성하여 면역 에게 짓다, 반면 증폭fi양이온 의 비-보호교차 반응HCV경골 ~에 따라 에게 그만큼 항원성 죄 원칙 5월 가지다 부정적인 영향30.

하지만협회우리와 같은 연구는 공식적으로 드fi네 인과관계, 그만큼 의미 의 우리의 조사 결과가 분명합니다: 이전면역 에게 HCV 5월 보호하다 에게 약간 정도 에 맞서 사스-코로나-2 인수, 그리고5월 제공하다 a 후원 에게 그만큼 개발 사스-코로나-2 특정fic 면역 그리고 ~와 함께 이것 낮추다 그만큼 위험 ~을 위한중증입원.  A  보통의HCoV의 보호 효과면역 ~일 것이다 ~이다 a 그럴듯한 설명 ~을 위한 그만큼 높은비율비대칭의토마틱 그리고 경증 사스-코로나-2 감염52,53. 조차 더 흥미로운 것은 미래의 관점입니다. 다른 사람들과 우리는가지다 표시, 사스-코로나-2 그리고 HCV 면역 에게 전염병 ~이다자주 ~ 아니다 긴-일종의 튼튼한 나사 (무화과. 5, 보충 무화과. 11)5,54, 제한저것  사스-코로나-2  백신희망에게극복하다. 해야 한다 사스-코로나-2  응답안에회전하다제공하다방어의 정도 HCV에 대한 전염병, 넓은 보호 에 맞서 코로나바이러스 r에있을 수 있습니다각.

무화과. 8 타격 의 HCoV 면역 ~에 코로나-19 심각성. a 협회 의 입원 상태 (~ 아니다 입원 (N = 16); 입원 ~ 아니다 안에 중환자실(N = 42); 입원 안에 중환자실 (N = 22)) 그리고 높은 또는 낮은 IgG HCoV 반동. 직사각형 크기 대응하다 에게 그만큼 비율 의 포함 환자. b 영향 HCoV 반동 (낮은/높은) ~에 그만큼 입원 상태 안에 a 부분집합 의 N = 80 환자, ~처럼 추정된 ~와 함께 승산 비율, 안에  서수 회귀 (레벨이 있는 = ~ 아니다 입원 (N = 16); 입원 ~ 아니다 안에 중환자실 (N = 42); 입원 안에 중환자실 (N = 22)) 그리고 a 물류 회귀 (참조 = ~ 아니다 입원(N = 16); ~ 대 모두 입원 (N = 64)). 데이터 ~이다 제시 ~처럼 매개변수 견적 그리고 그것의95%자신감 간격. 수준 의 의의 의 매개변수 ~이다 얻은 ~와 함께 a 둘-양면 t-테스트 (p-값 ~이다 표시 만약에 <>그렇지 않으면 가리키는 ~처럼 n.s.).

나토드

인간 표본. 혈청 그리고 혈장 샘플은 의 출현 전후에 수집되었습니다.

SARS-CoV-2스위스 (미리 그리고2월 이후 2020, 각기) ~이었다포함. 아니 인내심 있는 등록 ~였다 실시 ~을 위한 그만큼 현재 공부하다. 모두실험 관련된 샘플 ~에서 인간 기증자 ~이었다 실시 의 승인으로 응답이블 현지의 윤리학 위원회 (칸토날레 에티코미션) 취리히,

스위스 (베이스C Nrs 2020-01327, 2020-00363; 2021-00437; 2020-00787), 그만큼 식량 의 그만큼 선언 의 헬싱키 그리고 그만큼 좋은 임상 관행 지침 의 조화에 관한 국제 회의. 샘플 ~이었다 얻은 ~에서 다음 출처: (i) 취리히 헌혈봉사에스 (ZHBDS): 익명화 건강한 성인 혈장 ~에서 미리-전 세계적인 유행병 시각포인트들 (1월 2019, 5월 2019,2020년 1월) 첫 번째 물결부터 스위스 취리히의 전염병(5월 2020) ~이었다 제공 ~에 의해 그만큼 ZHBDS 내부 혈청 저장소 및 단점엔트 ~을 위한 이것 공부하다 ~였다 포기 ~에 의해 그만큼 윤리학 위원회(베이스C 2021-00437). (ii) 익명화 일상적인 진단에서 남은 표본 ~에 그만큼 학회 의 의료 바이러스학, 대학교 의 취리히, 그만큼 대학생 병원 취리히, 그리고 그만큼 주 병원 빈터투어 (베이스C Nrs2020-01327, 2021-00437). 모든 참가자로부터 서면 동의를 얻었습니다.누구의 샘플 WAs 찍은 ~ 동안 그만큼 전 세계적인 유행병 ~에 그만큼 대학교 병원취리히(BASEC 2020-01327). 다른 병원의 팬데믹 샘플의 경우d 미리전 세계적인 유행병 샘플 동의 ~였다 포기 ~에 의해 그만큼 윤리학 위원회. (iii) 의료RT-PCR을 가진 작업자는 SARS-CoV-2 감염을 확인했습니다이온 참여 안에 a 공부하다 ~에서 대학교 병원 취리히 (베이스C 2020-00363). 쓴 잘 아는 동의는 얻은 ~에서 모두 참가자들. (iv) 남성 혈장 기증자 참여 안에 사스-코로나-2 혈장 요법 공부하다 취리히 대학병원에서 실시(CPT-ZHP, 스위스메딕 2020TpP1004; 기초적인 2020-00787). 서면 통보연구에 대한 동의는 모든 참가자로부터 얻었습니다. 티그 보고 의 모두 인간 그리고 패티NT 데이터준수 ~와 함께그만큼스트로브 성명. 사전-전 세계적인 유행병 (사스- CoV{0}} 부정이브, N = 825) 그리고 범죄자fi르메드 사스-코로나-2 긍정적인 샘플 (N = 389)~이었다 각기 다른 ~ 안으로 훈련 그리고 확인 코호트 (보충 테이블 3).          사용 가능한 인구 통계 da고마워 ~에 성별, 나이, 시각 ~부터 긍정적인 RT-PCR 그리고s증상 습격, 그리고 입원 상태 ~이다 보고 안에 보충 테이블 11.그만큼 사스-코로나-2 훈련 보병대 (N = 175) 동안 수집된 혈장 포함감염(N=114) 및 회복기(N=61). 일당오노르 뿐 하나 견본 추출 시각포인트가 포함되었습니다, 론세로 샘플 의 기증자 포함 안에 그만큼 훈련 코호트는 ~ 아니다 포함 안에 그만큼 확인 언제 독립을 확인하기 위한 집단평가 그만큼 감광도 다양한 진단 방법의 특수성. 그만큼   사스-코로나-2 확인 보병대 (N = 214), 구성된 혈장 모은 감염 중 (N = 90, 기증자당 하나의 샘플링 시점) 및 회복기

(N = 124, 1-4개의 종단 샘플을 가진 79명의 회복기 환자). 여러 번포인트들 의 회복기 환자 ~이었다 포함 안에 그만큼 캡처를 위한 검증 데이터 세트 w의 넓은 스펙트럼애닝 항독소 역가. 단면 분석 ~였다 기반을 둔 ~에샘플 ~와 함께 모두 다 아는 시각 ~부터 긍정적인 RT-PCR (N = 369) 또는 모두 다 아는 시각 증상 이후 습격 (N = 333), 둘 다 종단 분석 관찰을 포함합니다.둘 다, 양성 RT-PCR 이후 경과 시간 및 시간~부터 습격 ~였다 모두 다 아는 ~을 위한330개 샘플, 3da의 중앙값 시간네 ~ 사이 징후 습격 그리고 RT-PCR(1성–3rd사분위수: 1–7일). 항체 반응성의 종단적 분석은 120개의 콘발에서 251개의 관찰에 대해센트 환자 ~와 함께 모두 다 아는 시각 ~부터 긍정적인 RT-PCR 및 증상 발병 이후 시간. 중화 was 정확히 잰 ~에 467 SARS-CoV-2 RT-PCR긍정적인 샘플 (N = 369 ~와 함께 모두 다 아는 시각 ~부터 긍정적인 RT-PCR, N = 333 ~와 함께 모두 다 아는 시각 ~부터 징후 습격).

우리는 교차 반응성 ABCORA 2.0 및 5.0 를 추가로 평가했습니다.t-~ 위에 혈장유행성 전염병 통제 그룹의 일상적인 진단 w이 문서화, 최근 HCV 전염병 (훈련 II, N = 75; OC43 (N = 27), 홍콩1 (N = 17), NL63      (N = 22), 229E (N = 9)). 순환 HCV ~이다 천하게 뿐 상영 ~을 위한 안에입원, 중증 호흡기 감염 및 면역 저하 개인누가 정기적으로 형제를 겪고기원 후 상영 ~을 위한 호흡기 감염. 따라서, 안에 이 환자 그룹, 둘 다 줄인 항독소 반동 ~로 인한 에게 면역성 있는 타협 또는상승된 HCV티바디 반동 ~로 인한 에게 최근의 또는 반복되는 HCV 전염병 5월발생하다. 이 그룹은 진단이므로단단히 관련 있는 우리 존경받는 그것 신중한 에게 이것을 포함 보병대 ~처럼 훈련 II 데이터 세트 에게 확인하다 만약에 십자가-반동 ~와 함께 사스-코로나-2 안에ABCORA 발생 이 설정에서. 훈련 II 데이터는 임계값에 포함되지 않았습니다. 드fi니션 에게 ~ 아니다 ~ 위에-대표하다 개인 심각한 질병으로. 이 HCV에 감염된그룹 표시 전반적인 낮추다 반동 ~와 함께 사스-코로나-2에서 플라즈마보다건강한 성인 하지만 중요하게 보여 주었다 아니요 표시 의 교차 반응성(그림.1a, b). 팬데믹 샘플레 ~에서 익명의 피 기증자 ~와 함께 알려지지 않은 사스-코로나-2상태 모은 안에 5월 2020 (N = 672) ~이었다 ~ 아니다 포함 안에 훈련 및 검증 코호트.

시약 및 세포주. 그의-티애지중지 사스-코로나-2-파생 항원 (수용체

결합 도메인(RBD), 서브유닛 S1(S1), 서브유닛 S2(S2), 핵이오캡시드 단백질 (N)) 및 t의 S1그 네 순환 HCoV (홍콩1, OC43, NL63, 229E) ~이었다 구입 한 Sino Biological Europe Gm에서bH, 에쉬본, 독일 (보충테이블 12). 검출 및 제어 항체의 출처, 특성 및 농도 ABCORA 및 중화 시험에 사용되는 혈청TS ~이다 나열 안에 보충 표 13. 293-T 세포는 American Type Culture Collection에서 입수했습니다.(ATCC CRL- 11268)55. HT1080/에이스2클. 14 세포33 ~이었다 친절한 P 제공.비에니아시, 록펠러 대학교, 뉴욕. 둘 다 셀 윤곽 ~이었다 세련된 안에 DMEM포함응10퍼센트FCS.

설계 의 다양한 구슬 시험 ABCORA 2.0. 우리 확립된 둘 구슬-기반을 둔다중화 SARS-CoV-2 면역분석 (ABCORA 2.0 그리고 ABCORA 5.0) 저것SARS-CoV-2 및 H의 범위 포함코로나 항원 (중국 생물학적 유럽GmbH, Eschborn, Germany, 보충 표 12). 4개의 SARS-CoV-2 항원ns- RBD, S1, S2, 그리고 N - ~이었다 포함 안에 둘 다 ABCORA 2.0 그리고 ABCORA 5.0.앙코라 2.0 포함 안에 덧셈 S1 의 HCV-홍콩1, 그리고ABCORA 5.0 포함 S1의 모두 순환 HCoV (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-홍콩1, HCV-OC43). ~ 안에 짧은, 개인 맥플렉스 염주 (루미넥스 법인, 오스틴, 텍사스)    유니크와 함께에 형광등 구슬 지역 ~이었다 선택된 ~을 위한 각 항원, 염주 ~이었다결합 및 항원 결합 비드의 혼합물s~이었다배양 ~와 함께 인내심 있는 혈장 안에 a 96-잘 그릇 세트-위로. 그만큼중앙값 형광등 강함 (MFI) 의 비드 결합 플라즈마항균시 ~였다 정확히 잰 활용 a 플렉스맵 3D 리더 (루미넥스 법인,오스틴, 텍사스). 우리 설계된 그만큼 시험 에게 가득fi이 그만큼 수행원 기준: (i) 높은 속도-시fi도시, 감광도, 그리고 재현성, (ii) 유연한 다양한 설계 저것 간단하게 허용 덧셈 그리고/또는 변경 의 항원; (iii) 넓은 동적 범위;  (iv) 선택 과목 수량fi양이온 의 항독소 응답; (v) 선택 과목 녹음 의항독소HCoV에 대한 반응 및 (vi) 일상적인 사용네 진단 그리고 연구.

우리는 스테레오를 선택했습니다 정위 포착 ~을 통해 안티-그의 항체 에게 보장하다 a 균질한 항원 표시. 따라서 카르복실화된 M애그플렉스 염주 (루미넥스

법인, 오스틴, 텍사스) ~이었다 결합 ~와 함께 안티-그의 항독소 (중국 생물학적

유럽 GmbH, 에쉬본,독일, 보충표 13) 이후 결합 그의 태그와 함께항원 사용 바이오-플렉스 아민 커플 링 (바이오-라드 실험실AG, Cressier, Switzerland) 제조업체의 i에 따라지시 그리고 ~처럼설명56.

혈청/혈장 적정은 일반적으로 가장 정확한 농도로 간주됩니다.테기 에게다시이브 정량적 정보 ~에 항독소 반동. 하지만, 안에 특수 증상 사용테스트 이상적으로 ~해야 한다 배달 (두 가구 연립 주택)-정량적 정보 ~에서 a 단일 혈청노동 희석 에게 허용하다 충분한 처리량. 최종 분석 조건은 2모든 조사된 항원-Ig 조합에 대한 -log MFI 범위(보충 그림 1).비준 그만큼 타당성 의 사용 a 하나의 혈장 노동 희석, 우리 범죄자fi르메드 저것 혈장~에서 사스-코로나-2 긍정적인 환자 그리고 미리-전 세계적인 유행병 사스-코로나-2부정적인혈장 샘플은 최적의 용량 반응을 나타냅니다. 곡선 ~ 위에 a 넓은 혈장 노동 희석범위 (보충 무화과. 1f). 중요한 것은, a 1/100 노동 희석 의 혈장 ~였다 안에 모두케이스 닫다 증가하는 플라즈마를 강조하는 최대 신호까지농도는 신호 강도를 증가시키지 않고 오히려 엔당을 증가시킵니다.어 감소시새끼 ~로 인한 에게 프로존 효과 (보충 무화과. 1f).

최대 안티-그의 항독소 로딩 ~였다 달성 ~에 5 µg 항독소 당 백만구슬(보충입문 무화과. 1c) 그리고 사용된 ~처럼 a 기준 커플 링 상태. ~ 안에 그만큼 fi날규약,500만 개의 항-His 항체 결합 자기 비드를 그의-태그가 지정된 항원 320nM의 농도로 PBS에 희석합니다.IgG에 특이적인 Phycoerythrin(PE) 표지 이차 항체, I가, 또는 IgM ~이었다검출기 항체로 사용(보충테이블 13). 품질 제어 의 그만큼항원 소에이딩 ~였다 수행 ~에 의해 인큐베이션 그만큼 염주 ~와 함께 단클론해당 CoV-d를 표적으로 하는 항체에리베드 항원 ~처럼 상세한 안에보충 표 12. 분석을 수행했습니다.h 그만큼 플렉스맵 3D 리더(루미넥스 주식회사n, 오스틴, 텍사스) ~와 함께 그만큼 인수 의 ~에 최소 50 염주 당구슬 지역. 결과답장 녹음 ~처럼 MFI 당 구슬 지역.

여러 통제 조치가 도입되었습니다.알린다 에게 명백히 하다상호 및 인트라-시험성능. 낮은 assay-to-를 확인하려면시험 변동성, 크기가 큰 배치 의개별 항원 로딩 b이즈 ~이었다 준비된 그리고 겨울 왕국 안에 분취량 ~까지 사용된 ~에-20 학위C 에게 우회그만큼부식 의 그만큼 항원-결합 구슬 (보충 그림 1). 개별 결합 비드를 시험 당일 혼합하여 yi노년 그만큼 필수의 항원구슬 칵테일. 칵테일에는 60개의 구슬이 들어 있습니다.어 구슬 지역 당 µl. ~ 안에 덧셈 에게SARS-CoV-2 및 HCV 비드 영역, 각 칵테일에는 비어 있음y 비드 영역 (아니요 항원 결합) 에게 제어 ~을 위한 불특정fic 제본. 품질 제어 및 검증 절차 ~을 위한 그만큼 플렉스맵 3D 기구 ~이었다 완료 ~에 각 낮 의실험 계정주문 에게그만큼제조사's 지침. 그만큼 변동성 의 그만큼 시험~였다 분석 ~처럼 따르다56: 혈장 샘플 ~에서 20 RT-PCR 범죄자fi르메드 사스-CoV- 2명의 감염된 환자를 모아서 테스트했습니다.버전 a 범위 의 일곱 희석 안에 31  다른 t반복 수행 ~에 10 다른 날 (보충 무화과. 2). 가로질러모두 항원 그리고 이그 클래스, 신호 ~이었다 보유 ~ 위에 그만큼 테스트 기간 의 25일 포스트 비드 커플링. t에 걸친 결합 신호의 변동 계수(CV)반복12가지 항원-Ig 클래스 조합 중민족 국가 증명 낮은 (범위: 0.010–0. 128, 중앙값  0.059, 보충 그림 3c, d, 보충 표 1, 2). 당일 및 당일변동성 p로브 낮은 그리고 유사한 (보충 무화과. 3e, f). 아래에 a 1/ 100 혈장 집중, 이력서 증가 현저하게 (보충 그림 3d),         1/100을 최고 농도로 정의~에 (가장 낮은 혈장 노동 희석) 에게 ~이다 테스트 안에 그만큼 시험. 따라서 1/100 플라즈마 희석이 기본으로 정의되었습니다.노동 희석 ~을 위한 상영 혈장 안에 ABCORA 2.0 언제 a 정성적(즉, SARS-CoV-의 존재 또는 부재 2특정 항체) 또는 반정량적(즉, MFI 신호 강도) 판독은r필수.

모든 ABCORA 측정값은 드리브 ~에서 하나의 측정 ~하지 않는 한달리 명시됨. SARS-CoV-2를 측정하려면c 항체 안에 인내심 있는 혈장,열 비활성화 혈장 (1 h ~에56도C) ~였다 희석 1/100 안에 PBS-BSA1퍼센트~하지 않는 한달리 명시됨. 50μl 희석에드 혈장 ~이었다 배양 ~와 함께 50 µl 의 그만큼 ABCORA항원 구슬 칵테일 ~을 위한 30 분 ~에 방 온도 안에 96-웰 플레이트, 세척 PBS-BSA 1%로 3회, 별도의 반응으로 배양피코에리트린 (체육)-라벨이 붙은 탐지기 항체 ~을 위한 IgG, 이가 또는 IgM ~에 a fi최종 농도 의 1/500 PBS-BSA 1% . 이 희석은 이전에 다음과 같이 정의되었습니다.최적의 MFI 신호를 생성하기 위한 검출기 항체의 적정. 45m 후이츠 의실온에서 인큐베이션, 비드를 P로 3회 세척하였다.BS-BSA1퍼센트그리고 분석 안에 96-잘 접시 FlexMap 3D 리더기(오스틴 소재 Luminex Corporation, 텍사스). A 최저한의 의 50 구슬 읽다 당 항원 ~였다 취득.

진짜 교차반응항체를 통제하기 위해예, 각 혈장 견본 ~였다비로 평가ds 없이 항원 (비어 있는 구슬 제어) 안에 콤비네이션 어느각 검출기항체. 을 위한 분석, 날것의 MFI 가치 ~이었다 변형 에게 MFI-적 에게 옳은 ~을 위한 배경 제본.우리는 평균 빈 비드 MFI-를 설립했습니다.팬데믹 이전의 건강한 기증자(N=1016) 및 se의 IgG, IgA 및 IgM에 대한 FOEt 평균 MFI-적...을 더한빈 비드 컨트롤에 대한 임계값으로 4x 표준 편차.~ 안에 순수한 수준, 이것들 임계값 양 에게 MFI-FOE 41.58(IgG), 55.91(IgA), 및 269.47(IgM).M측정 ~을 위한 어느 그만큼 비어 있는 구슬 제어 녹음 가치 아보이브 이것 한계점 ~이었다 존경받는 유효하지 않은 그리고 반복.

각 Luminex 분석 96-웰 플레이트는안에 그만큼 같은 세트 의제어 샘플, 즉 7 연속물 4-겹 SARS-CoV-2 양성 대조군의 희석기증자 수영장 (N = 20 기증자, 시작 노동 희석 1/100, 보충 무화과. 1f) 그리고 사전-전 세계적인 유행병 건강한 기증자 수영장 (노동 희석 1/100, N =20명의 기증자, 보충그림 1f). 이러한 양성 및 음성 대조군은 분석 수행을 제어할 수 있습니다.엔스독립적인 측정 전반에 걸쳐회고필요한 경우 외부 통제에 대한 표준화데드.

정의 의 사스-코로나-2 혈청 양성 안에 ABCORA 2.0 그리고 ABCORA 5.0. 에게SARS-CoV-2-특이한 교차 반응성 항체를 구별하기 위해 defi네드 MFI- 12개의 SARS-CoV-2 항원 및 Ig 클래스 조합 각각에 대한 FOE 임계값s 혈장 항체를 기반으로활동 안에 훈련 코호트 (보충 테이블 3 4). 여기에는 전염병 이전의 건강한 기증자 p가 포함되었습니다.라스마 (훈련 I, N = 573),기증자 ~와 함께 최근의 HCV 전염병 (훈련 II, N = 75; OC43 (N = 27), 홍콩1 (N = 17), NL63 (N = 22), 229E(N=9)) 및 SARS-CoV-2 감염이 확인된 기증자 (훈련 III, N = 175). 임계값 ~이었다 세트 에게 최소화가양성동안 보장 감광도 ~을 위한 사스-코로나-2항체 검출 및 도달전체 특이도 위e99퍼센트그리고 포함 수준 ~을 위한 국경-선 반동 ~을 위한 IgGRBD,IgG S1, 그리고 IgG N 에게 허용하다 또한 보통의 항독소 반동 에게 이것들 항원 to ~이다 검사. MFI-적 읽다 의 개인 샘플 ~이었다 변형 ~ 안으로신호 초과 컷오프(SOC) 값(MFI-FOE/임계값). SOC v알류스 ~이다 사용된 ~을 위한엉덩이노래 긍정적인 반동 ~을 위한 각 개인 항원-항독소 수업 콤비네이션, ~와 함께 SOC > 1은 양성 반응성을 나타내고 SOC < 1은 음성 반응성을 나타냅니다.언제 환경 개인 임계값, 그것 ~ 해야 하다 ~이다 존경받는 저것 ~을 위한 각 의 그만큼 12 조사 활동 교차반응이 일어날 수 있습니다. 12개의 개별 SOC 매개변수 사용 기록, 전체 속도시fi도시 ~ 할 것이다 감소하다 만약에 어느 긍정적인 SOC 독립적으로 서프fi세스 에게 비율 a 견본 전반적인 ~처럼 사스-코로나-2 항독소 긍정적인. 에게 예시하다:가정 독립적인 반응, 각 항원에 대한 높은 99% 특이성조차도 합산됩니다.o 전체 분석에 걸쳐 전반적으로 낮은 88% 특이도. 따라서 우리는 fo를 요구했습니다.r 사스-코로나-2 긍정적인 부름 안에 ABCORA 2.0 a 최저한의 의 둘 특정fi도시 에게 도달하다활동 ~ 위에그만큼한계점. 전체 SOC 값을 정의하는 데 사용되는 결합된 SOC 값주어진 샘플의 혈청 상태는 보충 표 5에 자세히 설명되어 있습니다. Ig의 경우G RBD, S1, 그리고 N,경계선 SOC 활동도 기록했으며,1 항원 반응성 SOC > 1의 조합, 두 번째 반응성 SOC > 경계선. 그만큼 fi날 한계점 그리고 긍정적인 전화 기준 허용된 ~을 위한 분화 부분적인 (일찍 혈청전환 ~와 함께 뿐 IgM 그리고 이가 응답) 에게 가득한 세르-          변환(포함루딩 IgG 응답) (보충 테이블 5). ~ 안에 덧셈, 기준 약한 반응성 및/또는 반응성이 불확실한 샘플을 나타냅니다.(보충 표 5).

비교를 쉽게 하기 위해엔 ABCORA 2.0 그리고 ABCORA 5.0 그만큼 같은한계점 ABCORA 5.0에 컷오프가 사용되었습니다. 우리는 특정 컷오프를 생성하지 않기로 결정했습니다.HCV 항체 반응성에 대한 역치로서n 정확한 드fi니션 의 a 부정적인HCoV에 광범위하게 노출되어 있기 때문에 반응이 복잡합니다.참을 수 있는항체 교차 반응티비 ~ 사이 그들을. HCV 응답 ~이었다 하지만 포함 통계에서칼 복수 ~처럼 MFI-적 가치.

정의 의 사스-코로나-2 혈청 양성 사용 물류 회귀 분류.

클라시fi양이온 의 혈청 양성 ~ 대 혈청 음성 샘플 안에 ABCORA 2.1 실현사용물류 회귀. 그만큼 동일한 훈련 그리고 확인 데이터 사용된 ~을 위한 그만큼 설립 의 ABCORA 2.0 ~이었다 사용된. 처럼 그만큼 ABCORA 2.0 결합 반응성 상관 관계가 높았으므로 모델에 다음 변수를 포함했습니다(보충 무화과. 6a): 그만큼 평균 값 모든 IgG MFI-FOE 반응(RBD, S1, S2, N)의 평균 값 의 RBD, S1 및 S2에 대한 IgA MFI-FOE 응답 및 평균 RBD, S1 및 S2에 대한 IgM MFI FOE 응답 값. IgA 및 IgM 반응s N은 동일한 I의 다른 응답과 클러스터링되지 않았기 때문에 제외되었습니다.g 수업 (보충 무화과. 6a). 로지스틱 회귀를 사용하여 추정하고 예측했습니다. 주어진 표본의 확률e 에게 ~이다 긍정적인 (p) ~처럼 설명 안에 방정식 (1).

파라미터  0, G, A, 그리고  M ~이었다 추정된 ~에 그만큼 훈련 데이터세트. A 견본 그런 다음 긍정적일 것으로 예상되는 확률이a 한계점 c/. 이 임계값은 최소 0.99의 특정성을 얻기 위해 정의되었으며 훈련 데이터 세트에 대한 최대 감도(유사하게 to c ~을 위한 그만큼 무작위의 숲). ~ 안에요약, 안에 ABCORA 2. 1, 새로운 샘플은 확률이 다음과 같은 경우 혈청 양성으로 정의됩니다. 로지스틱 회귀분석에 의해 추정된 혈청양성(seropositive)이 c/ 이상이다. 우리가 분석re R 버전에서 수행n 3.6.3. 정의 의 사스-코로나-2 혈청 양성 사용 무작위의 숲 분류.  혈청 양성 ve의 분류rsus 혈청 음성 샘플 안에그만큼문맥 의 앙코라 2.0 및 ABCORA 5.0은(는) rea입니다.라이즈 사용 a 무작위의 숲 접근하다 수행원 그만큼r의 기본 설정안돔 숲 ~처럼 설명 안에57. 그만큼 무작위의 숲 그 자체 ~였다 세워짐 MFI-FOE 응답(IgA, IgG,그리고RBD, S1, S2에 대한 IgM,N). 그만큼 개연성 의 a 견본 존재 긍정적인 ~처럼 미리-  랜덤 포레스트에 의해 결정되는 것은 p의 평균입니다.확률 ~ 위에 모두 1000 나무. 마지막으로 샘플이 정의됩니다.네드 ~처럼 긍정적인 만약에 그것의 개연성 의 존재 긍정적인 ~이다 ~ 위에 a 쓰레쇼ld c, 어느 ~이다 드fi네드 ~처럼 에게 얻다 a 특정fi도시 의 ~에 최소 0.99 그리고 a 최대 기차의 감도잉 데이터세트. ~ 안에 요약, 어느 새로운 견본 ~이다 드fi네드 ~처럼내가 혈청 양성이라면TS 개연성 의 존재 혈청 양성 ~처럼 추정된 ~에 의해 그만큼 무작위의숲은 thr 위에 있습니다eshold c. 우리 실시 a 시리즈 의 무작위의 숲 복수 SARS-CoV-2 응답만 고려하거나 SARS-CoV-2 및 HCV   응답 안에 ABCORA 2.0 및 ABCORA 5.0: ABCORA 2.2 및 ABCORA 2.3훈련 그리고 사용된 ~을 위한 예측 ~에 ABCORA 2.0 데이터 그리고 포함 뿐 사스-  코로나-2 응답 또는 사스-각각 CoV-2 및 HKU1 응답입니다. 앙코라 5.4 (SARS-CoV-2 응답만 해당) 및 ABCORA 5.5(SARS-코로나-2 그리고 HCV응답) ~이었다 훈련 ~에 ABCORA 5.0 데이터. 데이터 포함에 대한 세부 정보 각각의 모델 ~이다 나열 안에 보충 테이블 3 그리고 보충 테이블 10. packag를 사용하여 R 버전 3.6.3에서 분석을 수행했습니다.에스 랜덤 포레스트 그리고     레인저58–61.

결과의 견고성을 보장하기 위해 우리는 se를 수행했습니다.민감 분석 무작위화하여 5-중첩 교차 검증을 사용한 학습 및 검증 데이터세트방법. 두 세트의 긍정적인 그리고 네거티브 샘플 ~이었다 각기 다른 ~ 안으로 fi이브 동일한부속 그리고 우리 드fi네드 저것 방법 fi이브 확인 세트 (구성된 의 그만큼 i-일 세트 의긍정적이고그만큼 i-일 세트 의 네거티브, i = 1.5). 그만큼 쉬다 의 그만큼 데이터 ~였다 사용된 ~을 위한훈련 그만큼 ABCORA 2.3 랜덤 포레스트. 각 유효성 검사 세트에 대해 특이성 및감광도 의 그만큼 무작위의 숲 ~이었다 계산 ~에 그만큼 훈련, 확인, 그리고 훈련...을 더한확인 세트 (보충 표 6).

확인 그리고 확인 사용 외부 통제 수단. 우리 사용된 그만큼 안티-사스-  혈청학 분석을 위한 CoV-2 검증 패널(NIBSC 암호: 20/B770, NIBSC) 에게ABCORA 2.{1}} 및 ABCORA 2.3 테스트의 성능을 확인합니다. 혈청s충분한의 그만큼 베리fi양이온 패널 정확히 잰 ~에 의해 ABCORA 2.0/2.3 설명 및 결과NIBS에서 보고한 상업적으로 이용 가능한 분석 결과와 비교C (32 및 보충 표 7). 우리는그녀의 베리fi에드 그만큼 감광도 의 그만큼 ABCORA 2 테스트 안에 감지 사스-코로나-2 전염병 안에 상업과 직접적인 비교테스트. 안티브오디 상태 의 혈장 ~에서 사스-코로나-2 긍정적인 개인 (N = 171) 분석했다d ~와 함께 그만큼 수행원 테스트 시스템: 포함 테스트 시스템 표적 그만큼 N 단백질 (일렉시스® 안티-사스-코로나-2 (Roche Diagnostics GmbH)), RBD 지역 의 그만큼 S 단백질 (일렉시스® 안티-사스-코로나-2 S 분석(Roche Diagnostics GmbH)),그리고 그만큼 S1 소단위 (유로이문 안티-사스-코로나-2 엘리사 (IgG)) (보충표 8). 모든 분석은 에 따라 수행되었습니다.그만큼 제조사'지시 안에 그만큼 진단 단위 의 그만큼 학회 의 의료 바이러스학, 대학교 취리히, 스위스.